Veronica Mars est une jeune fille habitant à Neptune et vivant avec ses parents Keith et Lianne Mars. Sa vie bascule le jour où sa meilleure amie, Lilly Kane, se fait assassiner. De plus, une semaine auparavant Duncan Kane, son petit ami, la quitte sans explication. Son père en tant que shérif de la ville, accuse le père de Lilly d'avoir tué sa fille. Veronica choisit de rester auprès de son père sachant que tous ses camarades sont du côté du père de Lilly. Sa mère décide de les quitter et à cause du licenciement son père. Pour montrer à tout le monde qu'elle n'a pas honte de ce qu'a fait son père, elle se rend dans une soirée de Shelly Pomroy. Mais elle boit la drogue du violeur (GHB) et se fait violer durant la nuit, se réveillant seule le lendemain matin dans la chambre d'amis.

Un an plus tard, elle est au lycée de Neptune High et rencontre Wallace Fennel, qui devient son MAPLV: "Meilleur Ami Pour La Vie". Pendant la première saison de la série, elle essaie de trouver l'assassin de sa meilleure amie...