Lincoln "Alt" Lee est un personnage mystérieux. Lincoln Lee est une personne originaire de l'Univers Parallèle, étant en coexistence avec le Nôtre. Il travaille dans les Forces Spéciales dans la Division Fringe (équivalent du FBI dans Notre Univers). Il mène donc l’enquête sur des évènements surnaturels dans l’Univers Parallèle. On sait peu sur la vie de Lincoln, il ne semble pas avoir de proches et on peut le connaître uniquement à travers les actions qu’il mène au quotidien dans la division Fringe. Il est très ami avec l’Agent Francis et Olivia Dunham de l’Univers Parallèle. Il semble développer des sentiments amoureux à l’égard de celle-ci. La première fois qu’il fait son apparition, Lincoln manque de mourir victime d’une explosion. Grâce à la technologie développée dans l’Univers Parallèle, il survivra et devra rester en incubation pendant un certain temps afin de faire disparaitre les brûlures. A la suite de la disparition de l’Agent Broyles, il devient chef de la division. Il s’implique réellement dans les enquêtes et ne pose pas de questions ce que ses supérieurs apprécient.

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